同济大学在研究生招生过程中 不会歧视三本院校的学生。以下是一些支持这一观点的证据：
同济大学研究生招生考试条件及要求并未规定非985/211高校考生不得报考，且每年都有双非同学成功考入同济大学。
2. 同济大学在复试时并不歧视三本院校的学生，只要考生初试分高，复试表现好，就有机会被录取。
3. 从历年招生情况看，同济大学有较多招生名额，非985/211高校的考生通过努力也有机会成功上岸。
综上所述，如果你决心报考同济大学研究生，重要的是好好准备初试和复试，展示出自己的实力和潜力，而不是过分担心本科背景带来的歧视问题。