沈阳航空大学（现更名为沈阳航空航空航天大学） 曾经有三本的专业。沈阳航空航天大学北方科技学院作为其三本学院，曾设有多个专业，包括计算机科学与技术、电子信息工程、机械设计制造及其自动化（含数控技术、机械电子工程、模具设计与制造和汽车工程四个专业方向）、自动化、测控技术与仪器、国际经济与贸易、国际经济与贸易（投资经济方向）、信息管理与信息系统、信息管理与信息系统（电子商务）、市场营销、英语、网络工程、通信工程、车辆工程、公共事业管理等。
然而，需要注意的是，教育部门并没有明确划分沈阳航空航天大学北方科技学院是二本还是三本大学，毕业证上只有本科和专科之分，是几本只是民间的说法。此外，根据最新的信息，沈阳航空航天大学已经由原来的一本、二本、三本专业，转变为现在的一本专业。
因此，沈阳航空大学现在可能没有三本的专业了。建议您查阅最新的官方信息或直接联系学校以获取最准确的答案。