东南大学被称为“福建三本”的原因主要可以归纳为以下几点：
地理位置：
东南大学位于福建省福州市，而“福建”的简称与“东南”在地理方位上有重叠，这导致一些人误以为东南大学位于福建。
电视台的影响：
福建省有一个著名的电视台叫做东南卫视，这使得“东南”这个词与福建产生了紧密的联系。由于东南大学的校名中包含“东南”，不了解情况的人可能会误认为它在福建。
高校分类：
在福建省的高校分类中，并没有东南大学，而它在江苏省内也并非一本或二本高校，因此有人将其归类为三本大学。
学生的自嘲：
东南大学的学生有时也会自嘲地称自己为“福建三本”，这种戏谑的称呼进一步传播了这个梗。
尽管东南大学实际上位于江苏省南京市，并且是一所实力极强的985高校，但这些因素使得“福建三本”这个称呼在网络上广泛流传。