南京确实有一些位于市内的三本大学。以下是一些位于南京市区或离市区较近的三本大学：
东南大学成贤学院：
位于南京市江宁区，虽然地理位置稍远，但随着地铁的建设和交通便利性的提高，前往市区较为方便。
南京大学金陵学院：
同样位于南京市江宁区，离市区有一定距离，但也在逐步改善交通条件。
南京理工大学紫金学院：
位于南京市江宁区，交通便利，可以较为方便地前往南京市区。
南京航空航天大学金城学院：
位于南京市江宁区，离市区较近，随着地铁的建设和交通便利性的提高，前往市区较为方便。
南京师范大学中北学院：
位于南京市玄武区，地理位置较为便利，离南京市区较近。
南京医科大学康达学院：
位于南京市江宁区，交通便利，可以较为方便地前往南京市区。
南京中医药大学翰林学院：
位于南京市江宁区，离市区有一定距离，但也在逐步改善交通条件。
南京晓庄学院：
位于南京市雨花台区，地理位置较为便利，离南京市区较近。
南京财经大学：
位于南京市鼓楼区，地理位置较为便利，离南京市区较近。
南京审计学院：
位于南京市鼓楼区，地理位置较为便利，离南京市区较近。
这些大学都提供三本层次的本科教育，并且多数位于南京市内或其周边地区，交通便利。建议根据个人专业兴趣和地理位置偏好进行选择。