南通市的民办大学包括：
南通理工学院 所在地：
南通市
办学层次：本科
备注：南通理工学院是经国家教育部批准建立的一所全日制普通本科高校，创办于2000年6月。目前学校有南通和海安两个校区，占地面积68余万平米，建筑面积35余万平米。现有各类在校学生一万多人，设有机械工程学院、汽车工程学院、建筑工程学院、商学院、电气与能源工程学院、计算机与信息工程学院、基础教学学院、创新创业学院、继续教育学院等9个二级学院，设置本科专业31个。
南通大学杏林学院 所在地：
南通市
办学层次：本科
备注：南通大学杏林学院是经国家教育部批准成立的本科层次独立学院。学院始建于1999年2月，前身为南通医学院杏林学院，2004年5月在原南通医学院、南通工学院和南通师范学院合并组建南通大学后，更名为南通大学杏林学院。
南通职业大学 所在地：
南通市
办学层次：本科
备注：南通职业大学（Nantong Vocational University，简称南通职大）位于江苏省南通市，是一所经江苏省人民政府批准、教育部备案设置的综合性全日制普通高校，是全国办学历史最长的高等职业院校之一，是国家“双高计划”高水平专业群建设单位、江苏省示范性高等职业院校、全国高职高专人才培养工作水平优秀院校、教育部首批现代学徒制试点单位。
南通开放大学 所在地：
南通市
办学层次：本科
备注：南通开放大学（Nantong Open University）是在原南通广播电视大学基础上挂牌成立的，实现了学校从学历补偿教育向终身学习教育的华丽转身。学校积极推动职业教育、开放教育、社会教育“三育”融合，为南通人民打造终身学习的课堂、拓宽提升的渠道和产教融合的基地。
这些民办大学在教学质量、专业设置等方面都有一定的特色和优势，可以根据个人的兴趣和需求进行选择。