根据提供的信息，清末时期中国的一些著名大学在民国时期及现代软科排名中的情况如下：
国立中央大学（现南京大学）：
民国时期排名第1
2024年软科排名第6
国立清华大学（现清华大学）：
民国时期排名第2
2024年软科排名第1
国立北京大学（现北京大学）：
民国时期排名第3
2024年软科排名第2
国立浙江大学（现浙江大学）：
民国时期排名第5
2024年软科排名第3
国立交通大学（现上海交通大学）：
民国时期排名第6
2024年软科排名第4
国立武汉大学（现武汉大学）：
民国时期排名第4
2024年软科排名第3
国立同济大学（现同济大学）：
民国时期排名第7/8/9/10
2024年软科排名第16
国立中山大学（现中山大学）：
民国时期排名第8
2024年软科排名第12
国立南开大学（现南开大学）：
民国时期排名第9
2024年软科排名第20
国立河南大学（现河南大学）：
民国时期排名第10
2024年软科排名第97
这些排名反映了从清末到现代中国高等教育机构的变迁和发展。有些大学在民国时期排名靠前，而在现代排名中有所下降，而有些则保持了相对稳定的位置。