在江苏省昆山市，以下是三所二本大学：
昆山杜克大学：
昆山杜克大学是一所由美国杜克大学和中国武汉大学合作创办的非营利性中美合办高校，位于江苏省苏州市昆山市。它是一所具有独立法人地位的综合性研究型大学，于2014年秋季迎来首批学生，并于2018年秋季迎来首届本科生。
苏州大学应用技术学院：
该学院成立于1997年，是苏州大学的二级学院，前身为苏州大学职业技术学院。2002年1月，学院由公办二级学院改为公有民办二级学院，并于2003年11月正式更名为苏州大学应用技术学院。
硅湖职业技术学院：
硅湖职业技术学院是由著名教育家、建筑学家、美籍华人梁顺才博士于1998年创办，是经江苏省政府批准、教育部备案、计划内招生的全日制普通高校。它是江苏省创办最早的民办高校之一，为江浙沪地区培养输送了近二万名高素质、应用型人才。
建议：
昆山杜克大学和 苏州大学应用技术学院都是本科层次的高校，但昆山杜克大学是中外合作办学，而苏州大学应用技术学院是苏州大学的二级学院。
硅湖职业技术学院是一所专科学校，虽然民间有时将其称为“二本”，但它并不符合传统意义上的二本大学的标准。
根据以上信息，如果你在考虑报考江苏省昆山市的二本大学，建议重点关注 昆山杜克大学和 苏州大学应用技术学院，因为这两所学校的学历层次和办学质量较高。