在太原，最厉害的三本大学包括：
太原理工大学：
太原理工大学是一所以工科为主的综合性大学，航空航天工程、材料科学与工程、机械工程、能源动力类等专业非常强势。此外，太原理工大学也是山西省重点支持的高水平大学，是教育部与山西省人民政府共建的高校之一。
山西大学：
山西大学是山西省最早建立的高水平综合大学之一，文、理、工、管、法、教育、农科等专业比较齐全。山西大学在文学、历史、哲学等人文社科领域具有优势，并在金属材料、化学等领域具有较好的学术传统。
中北大学：
中北大学是教育部和山西省政府共建高水平大学，工、理、管、文、社科、艺术、体育等领域都有很好的学科覆盖。中北大学在信息商务学院方面表现突出。
此外，太原市的一些其他三本大学如山西应用科技学院、山西大学商务学院、太原理工大学现代科技学院、太原科技大学华科学院、山西工商学院等也较为知名。
建议在选择学校时，可以考虑学校的教学质量、师资力量、专业设置以及就业前景等因素，同时结合个人的兴趣和目标进行选择。