三本院校的学生在毕业时是有学士学位证书的。无论是统招生、专升本还是独立学院的学生，只要他们毕业考试成绩合格、在校表现良好，并满足所在学校的相关要求（例如英语过四级、专业成绩达到一定学分等），就可以获得学士学位证书。
虽然三本的学位在层次上可能较其他本科层次稍低，但它仍然是国家承认的学历，并且对于大多数就业机会、职业发展和继续深造提供了基础。因此，拥有三本学士学位的毕业生在适应社会需求、发展自身能力和追求个人理想方面仍具有重要意义。
建议学生在报考三本院校时，了解并确认所在学校对于获得学士学位的具体要求，以便更好地规划自己的学业和职业发展。