大连东软信息学院：
大连东软信息学院在软件工程方面表现突出，2015年部分省份已经将其纳入二本招生，同时也有三本招生。学院与东软集团有紧密的合作关系，提供国际化的教育环境和实际应用机会。
成都东软学院：
成都东软学院是东软集团旗下的另一所学院，软件工程是其优势专业，学院在四川等地区有较高的知名度。
北京航空航天大学北海学院：
虽然是一所独立学院，但其软件工程专业在全国独立学院中排名较高，综合星级为2星级，显示出一定的教学实力。
华侨大学厦门工学院：
这所学院的软件工程专业也颇受认可，综合星级为1星级，在全国独立学院中排名第193位。
中南财经政法大学武汉学院：
该学院的综合星级为4星级，在全国独立学院中排名第38位，软件工程是其优势专业之一。
北京师范大学珠海分校：
这所学校的软件工程专业在全国独立学院中排名第4位，综合星级为5星级，是广东省内较为知名的三本院校。
广州大学华软软件学院：
华软软件学院在全国独立学院中排名第51位，综合星级为3星级，软件工程是其重要专业。
集美大学诚毅学院：
诚毅学院在全国独立学院中排名第58位，综合星级为3星级，软件工程也是其优势专业之一。
南京工程学院、 浙江科技学院、 苏州科技大学等：这些高校在软件工程方面也表现不错，具体选择可以根据个人兴趣和地理位置来决定。
清华大学、 北京大学、 南京大学、 浙江大学、 上海交通大学、 哈尔滨工业大学等：这些顶尖高校的软件工程专业在全国具有极高的声誉和竞争力，但通常分数线较高，可能不适合一般的三本学生报考。
建议
大连东软信息学院和 成都东软学院是较为推荐的三本院校，与东软集团有紧密的合作关系，提供实际应用机会，就业前景较好。
北京师范大学珠海分校和 中南财经政法大学武汉学院也是不错的选择，综合排名较高，软件工程专业实力较强。
如果追求更高层次的教育，可以考虑报考 清华大学、 北京大学等顶尖高校，但需注意录取分数线较高。
请根据个人情况、兴趣及职业规划，综合考虑以上建议，选择最适合自己的学校。