民办大学和三本学校之间的区别主要体现在以下几个方面：
办学主体和性质
三本学校：通常是指国家教育部批准设立的本科高校，属于公办高校，学费相对较低，享受国家的财政拨款。
民办大学：是由社会力量或个人投资举办的，具有独立的法人资格，实行董事会领导下的校长负责制。民办大学的经费主要来源于学费和社会投资。
办学水平和质量
三本学校：教学设施、师资力量、学位授权等方面相对较为全面，可以提供更高质量的教育资源。三本高校都是国家教育部审批的正规统招高校，学籍都是电子注册，毕业生持有毕业证、学位证和派遣证。
民办大学：办学水平和质量参差不齐，有些学校可能具有一定的商业化倾向，不一定能够提供与三本学校相同的教育资源。
招生对象和就业情况
三本学校：招生对象主要是通过高考第三批次录取的学生，毕业生在就业市场上可能会面临一定的竞争压力，但考研和考公务员的机会相对较多。
民办大学：招生对象同样是通过高考录取，但毕业生在就业市场上可能面临更多的挑战，不过有些民办大学与知名企业有合作关系，可以提供较好的实习和就业机会。
学费和奖学金
三本学校：学费相对较低，学生可以享受国家的财政拨款和各种奖学金，生活压力相对较小。
民办大学：学费普遍较高，主要依靠学费收入来维持运营，学生需要承担较大的经济压力，但可以申请助学贷款和各种奖学金。
社会认知度
三本学校：由于是国家公办高校，社会认知度较高，毕业生在求职和升学方面具有一定的优势。
民办大学：社会认知度相对较低，毕业生在求职和升学方面可能会面临一些挑战，但部分民办大学由于与知名高校合作，教学质量较高，也能获得较好的就业和升学机会。
总的来说，民办大学和三本学校在办学主体、性质、办学水平、质量、招生对象、就业情况、学费和奖学金以及社会认知度等方面都存在明显的区别。学生在选择学校时，可以根据自己的兴趣、经济条件和发展目标，综合考虑这些因素，选择最适合自己的高校。