大学既有一本又有二本的原因主要可以归纳为以下几点：
院校合并：
一本大学和专科院校或者实力较弱的二本院校合并后，原来一本院校的专业依然会在一批次招生，而合并进来的院校的部分专业，由于师资力量、教学资源等方面的差距，可能会放在二本招生。
专业热度与实力差距：
学校的专业有强弱、冷热之分，通常优势学科、专业及就业好的专业会在一本招生，而相对弱一些、就业差一些的专业会放在二本招生。
主校区和分校区的差异：
有的高校分多个校区，分校区远离主校区且新开设的专业建设并不完善，整体师资力量、硬件设备和资源与主校区有一定差距，因此这些专业在招生时会考虑降批次录取。
响应国家政策：
为了给予更多的高中学生以更多的选择，一些大学会选择性地招收一些二本的学生，同时拓展自己学校的专业的丰富度。
专业设置和招生政策：
有些学校会根据专业的设置时间和质量、是否有硕士或博士点等因素，将专业分为一本和二本招生。
省份之间的教育差距：
有些大学在不同省份的招生批次不同，这也会导致同一所大学在不同省份既有一本又有二本的情况。
综上所述，大学既有一本又有二本主要是由于院校合并、专业热度与实力差距、主校区和分校区的差异、响应国家政策、专业设置和招生政策以及省份之间的教育差距等多种原因造成的。