南京的一本大学包括：
1. 南京大学
2. 东南大学
3. 南京航空航天大学
4. 南京理工大学
5. 河海大学
6. 南京农业大学
7. 中国药科大学
8. 南京师范大学
9. 南京邮电大学
10. 南京林业大学
11. 南京信息工程大学
12. 南京工业大学
13. 南京医科大学。
南京的二本大学包括：
1. 南京财经大学
2. 南京审计大学
3. 南京工程学院
4. 南京晓庄学院
5. 金陵科技学院
6. 江苏第二师范学院
7. 南京特殊教育师范学院等。
其中，部分高校如南京师范大学、南京工业大学、南京邮电大学、南京林业大学、南京信息工程大学、南京医科大学既可以算一本，也可以算二本，因为这些高校在全国招生中既有第一批次招生也有第二批次招生。