南京的二本医药大学排名如下：
南京中医药大学
排名：1
类型：医药
南京医科大学
排名：3
类型：医药
徐州医学院
排名：前10
类型：医药
南京工程学院
排名：前10
类型：医药
南京审计学院
排名：前10
类型：医药
建议：
南京中医药大学在医药类大学排名中表现突出，位居全国第8位，江苏第1位，是江苏省医药类大学的佼佼者。
南京医科大学在全国排名第54位，江苏排名第3位，也是医药类高校中的佼佼者。
其他如徐州医学院、南京工程学院和南京审计学院等也在医药类排名中占据一定位置，建议考生根据自身兴趣和职业规划，综合考虑这些因素进行选择。