南京的二本大学及其王牌专业如下：
南京晓庄学院 王牌专业：
小学教育、学前教育、应用心理学、社会工作、化学、计算机科学与技术。
金陵科技学院
王牌专业： 会计学、软件工程、材料科学与工程、土木工程、电子信息工程、服装与服饰设计、动画。盐城师范学院
王牌专业： 英语、数学与应用数学、汉语言文学、法学、教育学。南京工业大学
王牌专业： 化工、材料科学与工程。南京工程学院
王牌专业： 土木工程专业类、电气工程专业类、机械工程专业类。南京林业大学
王牌专业： 生态学、机械设计制造及其自动化、土木工程、轻化工程、交通工程、木材科学与工程、林产化工、风景园林。南京大学
王牌专业： 天文学、地质学、水文与水资源工程、软件工程、计算机科学与技术、经济学、国际经济与贸易、化学、行政管理、生物科学、数学与应用数学、环境科学、天文学、临床医学。东南大学
王牌专业： 建筑学、信息工程专业、城乡规划专业、电气工程及其自动化专业、交通工程专业、电气工程与自动化专业。南京航空航天大学
王牌专业： 飞行器设计、电气工程与自动化、工程图学、信息工程、机械工程及其自动化、交通运输、生物医学工程、工商管理等。南京农业大学
王牌专业：
作物学、植物保护、农业资源利用、兽医学、食品科学、科学技术史、畜牧学、公共管理等。
这些专业在各校中均具有较高声誉和就业竞争力，建议根据个人兴趣和职业规划选择适合的专业报考。