南京的公办三本大学排名如下：
南京大学金陵学院
学校为中国顶尖独立学院。
南京理工大学泰州科技学院
学校为中国顶尖独立学院。
中国传媒大学南广学院
学校为中国顶尖独立学院。
东南大学成贤学院
学校为中国一流独立学院。
南京航空航天大学金城学院
学校为中国高水平独立学院。
建议：
南京大学金陵学院、 南京理工大学泰州科技学院和 中国传媒大学南广学院在多个排名中均被评为顶尖独立学院，是南京地区三本大学中的佼佼者。
东南大学成贤学院和 南京航空航天大学金城学院也分别被评为一流和高水平的独立学院，具有较高的教育质量和学术实力。
这些排名综合了不同来源的数据，因此排名结果可能有一定的差异。建议考生和家长在选择学校时，可以综合考虑学校的教学质量、学科优势、就业情况等多方面因素。