三本大学的毕业证书是 国家承认的。三本大学是指在中国本科层次录取批次中排在第三位置的高校，其招生方式是根据参加全国统一高考录取的。三本是普通高等学校教育系列的一部分，学制为四年，毕业证书和学位证书都属于“普通高等学校”教育证书。
尽管有些单位或社会人士可能对三本大学的认可度不高，但从国家层面来看，三本毕业生的学历和文凭是受到认可的。他们可以参加公务员考试、职称晋升等，且三本的学籍是电子注册的，享有与其他普通高校相同的待遇。
建议您在选择学校时，可以综合考虑学校的教学质量、就业前景以及个人职业规划，而不仅仅是学历的层次。同时，对于用人单位来说，虽然可能有一些偏见，但只要是国家承认的学历，理论上都是可以使用的。