是的，东莞的民办大学在招生过程中实行摇号制度。具体来说，民办学校的录取方式包括电脑随机录取，即摇号。以下是相关信息的总结：
民办学校的摇号录取
民办学校在招生时，如果报名人数超过招生计划，将实行电脑随机录取。
摇号通常在7月份左右进行，并且录取结果会在现场公布，家长可以在招生报名平台上查询。
摇号的注意事项
摇中民办学校的录取结果并不是最终结果，家长需要在规定时间内完成注册手续，否则可能会面临后续修改手续的麻烦。
摇号入学政策使得一些热门学校的摇号录取率较低，而相对冷门的学校摇号录取率较高。
其他升学途径
除了摇号，学生还可以通过插班、直升和补录等途径升学。
一些名校的摇号率较低，因此直升入学的机会更大。
综上所述，东莞的民办大学在招生过程中确实实行摇号制度，家长和学生需要关注摇号时间、录取结果以及相关的升学政策，以便做出合适的选择。