关于民办大学三本部队是否承认的问题，可以得出以下结论：
国家承认：
三本大学作为国家承认的普通大学，其学历是得到国家认可的。
军队认可：
虽然军队在选拔士兵时更看重个人综合素质和实践经验，但三本文凭在军队中也会被认可，尽管权重可能较低。
不完全认可：
也有观点认为，三本大学的学历在军队中可能不会得到与本科和硕士相同的权重，但并非完全不认可。
综合以上信息，可以认为民办大学三本在国家和军队层面是得到一定程度的认可的，但具体认可程度可能会因个人综合素质、专业针对性以及军队的具体需求而有所不同。如果您有意向报考军队相关职位，建议进一步了解相关政策和具体部队的招聘信息。