南开大学的三本学院包括：
南开大学滨海学院：成立于2004年，是经教育部批准，由南开大学和天津市滨海新区人民政府合作创办的全日制普通本科高校，是南开大学的下属独立学院。
天津大学仁爱学院：由天津大学和天津市仁爱集团有限公司合作创办，具有独立法人资格和独立办学条件。
北京科技大学天津学院：由北京科技大学举办，是经教育部批准的本科层次全日制独立学院。
天津外国语大学滨海外事学院、 天津体育学院运动与文化艺术学院、 天津商业大学宝德学院、 天津医科大学临床医学院：这些也是天津地区较好的三本院校。
请注意，以上信息以发布时间为准，具体学院设置和排名可能会有变动，建议以学校最新公布的信息为准