民办大学在校生入伍是可以退还学费的。具体依据如下：
政策规定
根据《意见》，如果学生在校期间应征入伍，持区县人民政府征兵办公室发出的入伍通知书，学校将退还学生所缴纳本学年的全部学费。
重庆市的相关规定也明确指出，学生应征入伍（毕业生除外）的，当期所收的学费和住宿费应全额退还。
具体退费情况
民办学校学生退（转）学，学校应根据不同情况退还学生相应费用。其中，学生应征入伍的情况下，所有所收费用（包括代收代管费用）应全额清退。
其他相关信息
法律分析认为，在校期间应征入伍的学生不会退学费，但可以选择保留学业，两年后复原继续就读，并享受考学升学优惠，免交全部学费。
有一些情况下，学校可能会酌情减免学费，例如学生家庭困难或在部队上立功受奖等。
综上所述，民办大学在校生在应征入伍的情况下，是可以退还本学年的全部学费的。建议学生在入伍前与学校联系，确认具体的退费流程和所需材料，以确保顺利办理退费手续。