武汉大学和南京大学都是中国顶尖的综合性研究型大学，拥有悠久的历史和深厚的文化底蕴。以下是两校在几个方面的对比：
排名情况
软科大学排名：在2024年软科大学排行榜中，南京大学在学科水平、人才培养、科学研究、服务社会、高端人才、重大项目与成果、国际竞争力等维度占优，排名第6；而武汉大学排名第9。
QS世界大学排名：2024年QS世界大学排名中，南京大学位居全球第141名，武汉大学则位列第194名。
学科实力
南京大学：在基础学科领域表现突出，拥有8个A+学科，涵盖天文学、物理学、化学、计算机科学等多个领域。特别是在天文学和物理学等基础学科方面，南京大学不仅在国内名列前茅，在国际上也有较高的影响力。
武汉大学：学科分布广泛，尤其是在文、理、工、医等领域都有较强的实力。武汉大学的A+学科有5个，其中测绘学科在全球范围内独树一帜，被誉为“世界第一”。此外，武汉大学的水利工程、法学等学科也享有盛誉。
科研水平与国际影响力
南京大学：在科研产出和国际影响力方面表现强劲，尤其在自然科学、环境科学等领域的高被引论文和科研项目数量十分抢眼。南京大学在科研创新方面也取得了显著成绩，近年来在国家三大奖项上表现抢眼。
武汉大学：近年来在科研领域也取得了不俗的成绩，尤其是在测绘、遥感等领域的科研成果对国家战略有重要意义。武汉大学在国际上同样有着一定的学术影响力，特别是在“一带一路”倡议下，与多个国家和地区的科研合作不断深化。
录取分数线
南京大学：2024年高考全国30个省份的平均录取分中，物理类（理科）和历史类（文科）南京大学均高于武汉大学。物理类（理科）南京大学665.84分（全国第7），武汉大学638.49分（全国第19）；历史类（文科）南京大学643.10分（全国第7），武汉大学632.87分（全国第8）。
学校层次和定位
南京大学和 武汉大学都是我国部属顶尖高校，是国家“双一流”建设高校，按第一轮可以细分为“世界一流大学建设高校”。
国际化程度
南京大学与牛津、剑桥等世界名校有深入合作，国际化程度较高。
武汉大学在“一带一路”沿线国家建立了多个孔子学院，积极推进国际合作与交流。
历史底蕴
武汉大学始建于1893年，溯源于清末湖广总督张之洞奏请清政府创办的自强学堂。
南京大学可追溯至1902年，前身是创建于1902年的三江师范学堂。
综合来看，南京大学在软科大学排名和QS世界大学排名中略占优势，尤其在基础学科和科研方面表现更为突出。而武汉大学在应用学科和综合实力方面较为全面，特别是在测绘学科方面具有全球领先的声誉。在录取分数线方面，南京大学普遍高于武汉大学。两校都是中国顶尖的高等学府，各自在不同领域有着独特的优势和魅力。