东南大学被称为“福建大三本”的原因主要可以归纳为以下几点：
名字相似：
东南大学的名称中包含“东南”二字，这与福建的东南卫视等媒体机构名称相似，导致一些人将东南大学与福建联系起来。
地理位置误解：
从地理位置上看，“东南”一般指的是江苏、浙江、安徽、江西、福建一带，但由于东南卫视等媒体的影响，人们容易将东南大学误认为位于福建。
知名度不高：
东南大学相对于同城的老大哥南京大学来说较为低调，很多人并不了解它实际上是一所985和双一流高校，因此在福建的一本和二本大学名单中找不到东南大学，从而被一些人误以为是三本院校。
自嘲文化：
东南大学的学生有时也会自嘲地接受这个绰号，并将其作为一种校园文化的象征。
需要指出的是，东南大学实际上是一所实力强劲的985和双一流大学，在工科领域尤为出名，不应被这个绰号所低估