南京大学本身没有三本。南京大学是一所国家重点大学，属于985工程，过去是亚洲第一的大学。南京大学在1952年的全国大学院系大调整中拆分出10多所大学院校，现在还是985大学，可见南京大学的辉煌，成就了中国多所大学，被列为国家985。
不过，南京大学申办有南京大学金陵学院，这是本科层次的独立学院，也就是传统说法的三本，对外地招生。南京大学金陵学院是南京大学的重要下属学院之一，以其优质的教学质量和良好的学术氛围著称，在南京地区的教育界有较高的声誉和影响力。
因此，如果你是在询问南京大学本身是否有三本，那么答案是没有。如果你是在询问南京大学是否有下属的三本学院，那么答案是有的，即南京大学金陵学院。