东京大学：
作为日本最高学术殿堂和七所旧帝国大学之首，东京大学在全球享有高声誉。其环境科学专业在农学生命科学研究科和新领域创成科学研究科都有相关课程，涵盖了生产·环境生物学、生物·环境工学、自然环境学、海洋技术环境学等多个方向。
京都大学：
京都大学在环境科学研究方面也有显著成就，特别是在地球圈科学、生物圈科学、环境物质科学等领域。
北海道大学：
北海道大学是日本顶尖的国立大学之一，其环境科学研究科涵盖了环境起学、地球圈科学、生物圈科学、环境物质科学等多个方向，同时在工学、农学等领域也有深入的研究。
大阪大学：
大阪大学在环境科学领域也有较好的表现，特别是在环境工程、环境科学等方面。
筑波大学：
筑波大学的环境科学专业也较为知名，特别是在环境科学、环境工程等领域。
神户大学：
神户大学在环境科学、环境工程等领域也有较高的学术水平。
这些大学在环境科学专业方面都有较为深入的研究和广泛的应用，建议根据个人兴趣和职业规划，选择合适的大学进行申请。