截至2024年，西南交通大学的研究生专业目录主要包括以下几类专业：
土木工程学院
岩土工程
结构工程
市政工程
防灾减灾工程及防护工程
桥梁与隧道工程
道路与铁道工程
建筑与土木工程
交通运输工程
机械工程学院
机械工程
机械制造及其自动化
车辆新能源及工程
交通人工环境
供热、供燃气、通风及空调工程
经济管理学院
工商管理（MBA）
人文学院
哲学
经济学
法学
外国语学院
英语语言文学
艺术与设计学院
工业设计工程
建筑学
风景园林
数学学院
数学与应用数学
物理学院
物理学
化学学院
化学
生命科学学院
生物科学
计算机科学与技术学院
计算机科学与技术
电气工程学院
电气工程及其自动化
信息科学与工程学院
电子信息工程
通信工程
自动化
地理与遥感学院
地理信息科学
遥感科学与技术
心理与社会学院
应用心理学
政治学院
政治学
马克思主义学院
马克思主义哲学
环境科学与工程学院
环境科学与工程
交通运输学院
交通运输
材料科学与工程学院
材料科学与工程
力学与工程学院
力学
生命科学学院
生物医学工程
软件学院
软件工程
国际学院
国际商务
生命科学与技术学院
生物信息学
航空航天学院
飞行器设计与工程
航空宇航科学与技术
海洋科学学院
海洋科学
地球科学与工程学院
地球物理学
地球化学
建筑与城市规划学院
建筑学
城市规划
数学与统计学院
数学与应用数学
统计学
31. 物理与光电工程学院
物理学