南京农业大学 没有三本。南京农业大学是一所隶属于中央政府和教育部的大学，是国家“111计划”重点大学之一，也是“援疆学科建设计划”的参与高校。它在全国40所重点大学中排名第七，是全国46所建立高水平大学公共研究生培养计划的高校之一。南京农业大学拥有农业和生命科学优势和特色，农业、科学、经济、管理、工程、文学、法学等专业协调发展，是一所国家重点大学。
此外，南京农业大学工学院是南京农业大学的二级学院，并非独立三本，其专业都是标准一本，且归南京农业大学管辖。南京农业大学没有设立独立的三本学院，也没有一本以下的专业。
综上所述，南京农业大学是一所一本大学，没有三本专业。