南京的制药专业大学排名如下：
中国药科大学
排名：全国第三
地址：江苏省南京市
备注：双一流建设高校、211工程、985工程优势学科创新平台建设高校
南京中医药大学
排名：全国第二
地址：江苏省南京市
备注：本科公办
南京医科大学
排名：全国第三
地址：江苏省南京市
备注：本科公办
建议：
如果你希望进入国内顶尖的制药专业大学，中国药科大学无疑是首选，它在全国的排名中位居前列，并且拥有丰富的教学资源和科研实力。
南京中医药大学和南京医科大学也是南京地区制药专业非常优秀的学校，排名靠前，且均为公办本科，适合不同层次的学生选择。