中国拥有高水平棒球项目的大学包括：
北京体育大学：
作为专业的体育学府，北京体育大学拥有完善的体育设施和专业的教练团队，提供高水准的棒球训练和比赛机会，并且学校还开设了棒球专业课程。
北京大学：
作为顶尖学府之一，北京大学拥有棒球俱乐部，并提供参与棒球运动的机会。
清华大学：
虽然非主打项目，但清华大学设有棒球队伍，定期组织训练和比赛。
厦门大学：
厦门大学在高水平棒球招生学校之列，提供专业的棒球训练和比赛机会。
上海外国语大学：
上海外国语大学也是高水平棒球招生学校之一。
北方工业大学：
北方工业大学在高水平棒球招生学校之列，提供专业的棒球训练和比赛机会。
华东政法大学：
华东政法大学也是高水平棒球招生学校之一。
南京工业大学：
南京工业大学在高水平棒球招生学校之列。
北京师范大学：
北京师范大学提供棒球课程和相关训练。
北京航空航天大学：
北京航空航天大学提供专业的棒球训练和比赛机会。
此外，日本的早稻田大学、东京大学和庆应义塾大学等也是棒球运动非常知名的大学，隶属于“东京六大学棒球联盟”。
综上所述，若以专业性和训练水平为主要考量因素， 北京体育大学在众多高校中处于领先地位，其次是北京大学和清华大学。若考虑国际知名度和影响力，早稻田大学、东京大学和庆应义塾大学等日本高校也具有很高的水平。