系统科学与工程专业排名情况如下：
研究型排名 （根据2024年校友会排名）：冠军：
北京师范大学（3, A++）
亚军：上海理工大学（2, A+）
季军：北京交通大学（2, A+）
应用型排名 （根据2024年校友会排名）：排名前三强的大学包括深圳技术大学、合肥大学和重庆科技大学。
综合排名
（根据2024年教育部门第四轮系统科学学科评估结果）：
北京交通大学： 系统科学 A+ 国防科技大学
上海理工大学：系统科学 B
请注意，排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。建议参考最新的排名信息进行选择