三本大学被称为农民工大学的原因主要有以下几点：
学费较高：
三本大学大多数是民办的，学费相对较高，最便宜的院校每年也要一万多元。这使得一些经济条件有限的家庭，特别是农村家庭的孩子难以承担。
教育资源有限：
在教育资源不发达的地区，农村学生往往在偏科的情况下参加高考，最终考取分数较低的三本院校。这些学生在大学期间发奋图强，毕业后在就业市场上表现优秀，并不比一本院校的学生差。
学历认可度：
尽管三本院校是国家承认的学历，但在就业市场上，三本毕业生的竞争力相对较弱。由于大学生数量众多，一本和二本的毕业生也面临就业难的问题，三本毕业生的就业形势更为严峻。
学术和技能：
三本院校在学术上没有211、985院校那么高深，技能方面又没有专科学生那么扎实。这使得三本院校在就业市场上处于一个较为尴尬的位置。
综上所述，三本大学被称为农民工大学，主要是因为它们学费高、教育资源有限，尽管如此，许多农村学生在这些学校通过努力也能取得不错的就业成绩。