二本院校的学生想要申请日本的大学，可以考虑以下途径：
日语授课
直考：可以直接参加日本的修士入学考试，这种方式不看出身校，主要看答题的正确数量。
研究生：申请日本的研究生（即旁听生）项目，通过语言学校和导师的推荐进入大学院学习。
语言学校：申请语言学校，通过学习日语和专业课，准备参加修士入学考试。
英语授课的SGU项目
SGU（Super Global University）项目是日本部分大学提供的全英文授课项目，申请时需要提交GPA和英语成绩等材料。
申请建议：
选择适合的专业：根据个人兴趣和专长选择适合的专业，文科方向在日本大学院中较为常见。
语言准备：尽早准备日语或英语语言成绩，日语建议最晚在大三12月报考N2，大三7月报考N1。
突出软实力：准备一份研究计划书，展示你的科研能力和研究兴趣。
成功案例：
有学生通过一年的努力，成功考到日语N1证书，并考入了日本排名前15的学校。
注意事项：
学科差异：不同学科的竞争程度不同，理工科在日语授课的大学院中可能更具优势。
申请难度：随着来日本的学生水平提高，申请难度也在逐渐增加，不仅限于学历的竞争，还包括个人条件的竞争。
总结：
二本院校的学生想要申请日本的大学，有多种途径可以选择，重要的是根据自己的语言能力、专业背景和兴趣，选择合适的申请方式和目标学校，并进行充分的准备。