南京有几所大学的物理学院是三本的，具体如下：
南京大学金陵学院：
南京大学金陵学院是南京地区重要的三本学院，在人文社科领域有较高的学术声誉，注重培养学生的综合素质和创新能力。
南京师范大学中北学院：
南京师范大学中北学院是南京较好的三本大学之一。
南京理工大学紫金学院：
南京理工大学紫金学院是南京理工大学二级学院，与南京理工大学有紧密的合作，共享部分教学资源。
南京航空航天大学金城学院：
南京航空航天大学金城学院是南京较好的三本大学之一。
南京信息工程大学滨江学院：
南京信息工程大学滨江学院是南京较好的三本大学之一。
南京财经大学红山学院：
南京财经大学红山学院是南京较好的三本大学之一。
南京中医药大学翰林学院：
南京中医药大学翰林学院是南京较好的三本大学之一。
南京邮电大学通达学院：
南京邮电大学通达学院是南京较好的三本大学之一。
金陵科技学院龙蟠学院：
金陵科技学院龙蟠学院是南京较好的三本大学之一。
南京医科大学康达学院：
南京医科大学康达学院是南京较好的三本大学之一。
建议您根据自己的兴趣和专业需求，选择合适的学院进行报考。