南京理工大学确实 有三本学院，即南京理工大学紫金学院。以下是关于南京理工大学三本学院的具体信息：
南京理工大学紫金学院
南京理工大学紫金学院是由江苏省人民政府与南京市联合创建的一所全日制普通本科高校。
该学院依托于南京理工大学的师资力量与教育资源，是一所综合实力强劲的三本院校。
紫金学院位于南京市仙林大学城，临近南京邮电大学。
虽然教育部门并没有明确划分南京理工大学紫金学院是二本还是三本，但在江苏，该学院是本科批次招生，因此通常被认为是本科大学。
其他信息
南京理工大学泰州科技学院也被提及为南京理工大学的三本学院。
南京理工大学仙林校区也属于三本，但通常认为该校区是紫金学院的一部分。
综上所述，南京理工大学确实有三本学院，分别是南京理工大学紫金学院、南京理工大学泰州科技学院和南京理工大学仙林校区（紫金学院）。建议您在选择学院时，可以综合考虑各学院的师资力量、教学设施以及就业情况等因素。