南京医科类的二本大学包括：
南京医科大学：
南京医科大学是江苏省属重点建设大学，教育部卓越医生教育培养计划试点高校，江苏省高层次人才培养计划333工程培训基地。学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院，1957年迁至南京，更名为南京医学院。南京医科大学在江苏既有第一批次招生也有第二批次本科招生，但通常被认为是二本大学。
南京医科大学康达学院：
虽然南京医科大学康达学院是三本院校，但在江苏是本科批次招生，因此也可以认为它是一本大学。如果考生所在省份将南京医科大学康达学院视为二本大学，那么它也可以被归为南京医科类的二本大学。
建议：
对于江苏考生，南京医科大学通常被认为是二本大学。
对于非江苏考生，如果南京医科大学康达学院在其所在省份是二本大学，则可以将其视为南京医科类的二本大学。