重庆工商大学的王牌专业包括：
经济学：
国家级特色专业，市级特色专业，市级“三特行动计划”资助专业，2018年获批重庆市唯一的“应用经济学”一流专业。
金融学：
国家级特色专业，也是工商大学大力发展的专业之一。
会计学：
工商大学历来最好的专业之一，也是国家级特色专业。
市场营销：
国家级特色专业。
工商管理：
国家级特色专业，市级特色专业。
环境工程：
重庆市级特色专业。
贸易经济：
国家级特色专业。
应用化学：
重庆市级特色专业。
物流管理：
重庆市级特色专业。
统计学：
重庆市级特色专业。
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