南京确实存在不是一本大学的院校，以下是一些具体的例子：
南京工业大学：
虽然南京工业大学在第四轮学科评估中表现突出，拥有博士后科研流动站和一级学科博士学位授权点，但根据2024年最新的信息，它通常被认为是二本大学。
南京工程学院：
这所院校主要专注于工程技术，是江苏省属的工科型二本院校。
南京晓庄学院：
以师范教育为特色，历史悠久，是南京市民办教育的佼佼者，也被视为二本大学。
南京信息工程大学：
虽然是一所民办大学，但在信息技术领域享有很高的声誉，通常也被认为是二本大学。
南京审计大学：
以独特的审计专业在民办大学中独树一帜，毕业生就业率一直保持高位，同样被视为二本大学。
南京工业职业技术大学：
这所院校是江苏省属的职业技术大学，通常也被认为是二本大学。
三江学院：
这所学院是一所民办本科院校，通常也被认为是二本大学。
南京体育学院：
这所学院专注于体育教育，是二本大学。
南京艺术学院：
这所学院以艺术专业为主，是二本大学。
南京特殊教育师范学院：
这所学院专注于特殊教育，是二本大学。
南京森林警察学院：
这所学院是江苏省公安政法类本科院校，也是二本大学。
金陵科技学院：
这所学院是二本大学。
南京传媒学院：
这所学院以传媒专业为主，是二本大学。
江苏第二师范学院：
这所学院是二本大学。
这些院校虽然在南京乃至全国都有一定的知名度和影响力，但由于各种原因，它们并未被列入一本大学的范畴。建议学生在选择高校时，可以根据自己的兴趣和专业需求，综合考虑这些二本大学的办学实力和特色。