国内二本最厉害的大学可以从不同角度进行评价，以下是几所较为突出的二本大学：
哈尔滨医科大学：
全国排名第51位，以医学领域为主，尤其在临床医学、基础医学和药学方面具有国内顶尖水平。
北京中医药大学：
全国排名第83位，是中医药领域的顶尖院校之一，中医学和中药学等学科历史悠久且实力强劲。
重庆医科大学：
全国排名第86位，西南地区重要的医学教育基地，在临床医学、护理学、药学等领域具有较强教学和科研能力。
福建师范大学：
全国排名第87位，福建省内最具实力的师范类高校之一，教育学、文学、心理学等学科影响力强。
温州医科大学：
全国排名第95位，在医药领域享有盛誉，尤其在眼科学和临床医学方面学科优势明显。
河北医科大学：
全国排名第121位，虽排名较后，但在临床医学和药学方面表现突出。
南京工程学院：
具有百年办学历史，深厚工科底蕴，拥有电气工程及其自动化、机械设计及其自动化等优势专业，就业前景好。
上海海关学院：
地处上海，直属于国家海关总署，海关管理、税收学等专业优势明显，毕业生进入海关的比例高。
广东财经大学：
由国家和广东省政府联合创立，经济、金融等学科教学质量高，毕业生就业率高。
桂林电子科技大学：
在电子信息领域实力强，机械工程、仪器科学与技术等学科评估成绩优异。
这些大学在各自的领域具有明显优势，无论是医学、师范、金融还是电子信息，都有较高的教学水平和就业竞争力。建议根据个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的学校。