江南大学本二阶段的学院包括：
机械工程学院
党委书记：高雪梅
院长：赵军华
院训：厚德求实，博学践行
特色专业：机械工程和包装工程（国家“双万计划”一流本科专业）
硕士点：机械工程一级博士点和一级硕士点、包装工程二级学科硕士点
学科：机械工程入选江苏省“十四五”重点学科和首批江苏省课程思政示范专业
生物工程学院
党委书记：程捷音
院长：刘龙
特色专业：生物工程（国家级特色专业、江苏省品牌专业）、生物技术（国家级特色专业）
硕士点：轻工技术与工程一级学科博士授权点、生物学一级学科学术学位硕士授权点、生物与医药专业学位硕士、博士授权点
学科：轻工技术与工程在教育部学科评比中位居全国并列第一、第二和A+
食品学院
（注：虽然食品学院在2023年11月的关工委优质化建设达标学院通知中被提及，但未明确其是否属于本二阶段学院，此处暂且列出）
环境与土木工程学院
（注：同样，环境与土木工程学院在2023年11月的关工委优质化建设达标学院通知中被提及，但未明确其是否属于本二阶段学院，此处暂且列出）
物联网工程学院
（注：物联网工程学院在2023年11月的关工委优质化建设达标学院通知中被提及，但未明确其是否属于本二阶段学院，此处暂且列出）
外国语学院
（注：外国语学院在2024年4月的资料中被提及，但未明确其是否属于本二阶段学院，此处暂且列出）
电子工程学院
（注：电子工程学院在2024年4月的资料中被提及，但未明确其是否属于本二阶段学院，此处暂且列出）
设计学院
党委书记：王维青
院长：魏洁
特色专业：工业设计（全英文）、产品设计、环境设计、视觉传达设计、公共艺术、美术学（师范）、服装与服饰设计、数字媒体艺术、服装设计与工程、表演
硕士点：“设计学”一级博士点、“设计学”和“美术学”一级学科学术型硕士点、“数字媒体艺术设计及理论”二级学科学术型硕士点、“艺术设计”专业学位型硕士点
学科：原为无锡轻工大学设计学院，始建于1960年
建议：
食品学院、环境与土木工程学院和物联网工程学院在2023年11月的关工委优质化建设达标学院通知中被提及，但未明确其是否属于本二阶段学院，建议进一步核实。
外国语学院和电子工程学院在2024年4月的资料中被提及，但未明确其是否属于本二阶段学院，建议进一步核实。