重庆的二本军校有：
中国人民解放军第三军医大学，简称“第三军医大学”，位于重庆市，是一所具有75年办学历史的全国重点大学，也是军队“2110工程”重点建设院校。
中国人民解放军后勤工程学院，位于重庆市，隶属于中国人民解放军总后勤部，是一所培养全军后勤通用专业军事人才的高等教育院校，主要承担后勤综合业务、后勤基层管理、油料勤务、军需勤务、军事设施勤务、军事物流管理、军事物资采购管理、财务审计等领域的培训任务。
建议：
如果你对医学专业感兴趣，第三军医大学是一个非常好的选择。
如果你希望从事军事后勤相关的工作，后勤工程学院会是一个合适的院校。