西南交通大学自创立以来，历任校长如下：
吴调卿（1896.10-1897.10）
罗仙桥（1897.10-1898.09）
胡叔博（1898.09-1898.12）
蓝轶符（1899.01-1900.09）
梁如浩（1905.05-1905.07）
周寿臣（1905.07-1906.09）
方伯梁（1905.07-1908.06）
罗惇曧（1908.01-1908.06）
熊崇志（1908.06-1912.07）
赵仕北（1912.7-1916.8）
骆通（1916.8-1917.7）
章宗元（1917.7-1920.6）
刘式训（1920.6-1921.7）
叶恭绰（1921.5-1922.5）
罗忠忱（1921.7-1922.7）
胡叔伯（监督， 1897.10-1898年秋）
兰轶符（监督， 1898年秋-1898年冬）
梁如浩（总办， 1902.5-1905.7）
周寿臣（总办， 1905.7-1906.9）
方伯梁（监督， 1905.7-1908.6）
罗敦曧（坐办， 1908.1-1908.6）
熊崇志（监督， 1908.6-1912.7）
赵仕北（1912.7-1916.8）
骆通（1916.8-1917.7）
章宗元（1917.7-1920.6）
刘式训（1920.6-1921.7）
叶恭绰（交通大学总校校长， 1921.5-1922.5）
罗忠忱（1921.7-1922.7）
后续校长名单：
刘圣化（1978.8至1982.1）
阎涛（1982.1至1983.10）
31. 王润霖（1983.10至1985.10）
32. 沈大元（1985.10至1993.6）
33. 孙翔（1993.6至1995.3）
34. 胡正民（1995.5至1997.12）
35. 周本宽（1997.12至2007.2）
36. 陈春阳（2007.2至2013年9月）
37. 徐飞（2013年9月至2019年9月）
38. 杨丹（2019年9月至今）
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