南方的医科考研大学排名如下：
1. 北京协和医学院
2. 首都医科大学
3. 南方医科大学
4. 天津医科大学
5. 中国医科大学
6. 北京大学
7. 中山大学
8. 华中科技大学同济医学院
9. 中南大学湘雅医学院
10. 重庆医科大学
11. 第二军医大学
12. 哈尔滨医科大学
13. 南京医科大学
14. 苏州大学
15. 广州医科大学
16. 广州中医药大学
17. 广东医科大学
18. 广东药科大学
这些排名综合了不同年份和不同来源的数据，因此排名可能有一定的变动。建议在具体选择院校时，还需结合自己的兴趣、专业目标及实际情况进行综合考虑。