三本大学的由来可以从以下几个方面进行解释：
高考录取批次
三本大学主要是指在高考录取时第三批录取的本科高校。这个批次包括了独立学院和民办本科高校，它们通常在本科录取批次中排在第三位置。
独立学院与民办院校
三本大学多数是由原来的高校下设的独立学院或民办院校发展而来。这些学院或院校大多数是民办性质，但也有部分转成了公办。
政策背景
三本的设立与我国高等教育扩招政策有关，旨在吸引民间资本投入教育领域，推动国家教育事业的发展。
民间说法
虽然教育部门并没有直接规定哪些学校是一本、二本或三本，但这些名称在民间广泛流传，用于区分不同批次的录取高校。
改革与发展
近年来，随着教育改革的深入，一些三本院校开始独立办学，有的甚至成功转制为公办高校。尽管如此，三本院校仍然是一个合法且正规的教育机构，毕业生能够获得由国家教育部颁发的本科学历证书。
批次合并
值得注意的是，随着一些省份开始合并本科批次，原本的三本批次已经逐渐被取消。因此，现在提及三本大学时，需要考虑到这一变化。
综上所述，三本大学这一概念主要是基于高考录取批次和院校性质而来的，它们在我国高等教育体系中占有一席之地，尽管近年来有所改革和发展。