上海在市区的二本大学包括：
1. 上海海事大学
2. 上海理工大学
3. 上海师范大学
4. 上海中医药大学
5. 上海电力学院
6. 上海海关学院
7. 上海工程技术大学
8. 上海电机学院
9. 上海金融学院
10. 上海立信会计学院
11. 上海海洋大学
12. 上海商学院
13. 上海应用技术学院
14. 上海政法学院
15. 上海公安学院
16. 上海体育大学
17. 上海健康医学院
18. 上海建桥学院
19. 上海杉达学院
这些大学都是上海市区内的二本大学，涵盖了工、理、文、经、管、法、艺术等多个学科领域。建议学生在选择学校时，可以根据自己的兴趣和专业需求，综合考虑学校的排名、学科优势以及录取分数线等因素。