马来西亚国立大学（UKM）
排名第一，马来西亚最大的公立研究型大学，提供包括商科、工程、科学、教育、文学、医学、法学等学科。
马来西亚理工大学（UTM）
排名第二，著名的公立研究型大学，主要提供工程、科学、计算机科学、建筑、环境、商业、管理、社会科学、教育、健康等相关课程。
马来西亚华侨大学（UCSI）
排名第三，著名的私立研究型大学，主要提供商科、工程、计算机科学、艺术、教育、健康等相关课程。
马来西亚国际会计师学院（MIA）
排名第四，以会计学为主的大学，致力于培养学生的会计技能和社会责任感。
此外，根据2024年QS世界大学排名，马来西亚的研究生大学中，马来亚大学位列第60位，马来西亚理科大学位列第146位，博特拉大学位列第148位，马来西亚国立大学位列第138位，马来西亚理工大学位列第181位。
这些排名综合了不同来源的数据，因此排名结果可能有一定的差异。建议在选择硕士大学时，可以综合考虑学校的教学质量、研究设施、师资力量以及个人职业规划等因素。