东京大学
东京大学的风景园林研究生课程由三谷徹教授，研究方向包括风景园林的现代主义、园林设计史、风景文化遗产、土地复垦、环境艺术、土地艺术、城市空间、基础设施、森林、河流、海岸、公园、花园等。东京大学是综合性高校的代表，其风景园林设计专业位于工程部，涉及空间、城市、生态、水等多个方面。
东京工业大学
东京工业大学是日本理工科大学之最，其都市环境专业横跨建筑学系和土木环境工学系，整体偏规划。教授在城市规划、观光地规划、绿地规划等领域有广泛的研究。景观研究室历史悠久，教授偏理论研究，方向包括景观规划理论、景观论、近代城市设计特征、关于地形认识的形象论研究等。
千叶大学
千叶大学园艺学部已有百年历史，是日本国立大学中唯一的园艺学部。学部包括园艺部门（栽培和育种学、生物生产环境学）、应用生物化学系、绿色空间环境系（环境造园学、绿地科学、环境健康学）、食品资源经济学系（食品系统学、资源环境经济学）等四个部门。千叶大学在国立大学中，是仅此一所拥有独立研究科-园艺学研究科的大学，此研究科中几乎包含了更园艺学相关的所有研究课题。
京都大学
京都大学是世界顶级综合研究型国立大学，虽然未详细列出园艺专业的排名，但其在农学研究科等方面具有很高的学术水平。
东京农业大学
东京农业大学是日本成立较早的私立农业大学，其农学专业在风景园林方面也有显著的研究和应用。
建议：
东京大学和 东京工业大学在风景园林领域具有很高的学术声誉和研究实力，适合对现代主义设计、城市规划和生态环境等方面有浓厚兴趣的学生。
千叶大学在园艺学方面有百年历史，拥有独立的研究科，适合希望深入研究园艺学的学生。
京都大学和 东京农业大学也是不错的选择，尤其是对于希望在农业和生命科学领域发展的学生。