全国最好的中医药大学包括：
北京中医药大学
简称“北中医”，是教育部直属的全国重点大学，以中医药学科为特色，是国家“双一流”世界一流学科建设高校。
上海中医药大学
简称“上中医”，是新中国首批建立的中医药高等院校之一，也是教育部与地方政府“部市共建”的第一所中医药院校。
南京中医药大学
是江苏省人民政府与国家中医药管理局共建高校，享有“高等中医教育的摇篮”的美誉。
广州中医药大学
是新中国首批建立的四所中医药高等学校之一，现为广东省“211工程”重点建设高校和高水平大学重点学科建设单位。
成都中医药大学
以及其他如天津中医药大学、福建中医药大学等，都是国内知名的中医药大学。
根据不同的排名和评估结果，北京中医药大学在多个排名中均位列前茅，被认为是全国最好的中医药大学之一。