关于工程系大学是一本还是二本的问题，需要具体分析每所大学的实际情况。以下是一些具体信息：
沈阳工程学院
原沈阳工业学院，是一所二本院校，但某些专业在某些省份和地区可能被视为接近一本水平。
沈阳工业大学
属于辽宁省重点建设的高水平大学，具有多个本科专业的一本招生资格，整体教育实力较强，属于一本批次录取的高校。
武汉工程大学
被认为是一本大学，覆盖工、理、管、经、文、法、哲、教、医、农等十大学科，是湖北省重点建设高校和国内一流学科建设高校。
成都理工大学工程技术学院
通常被认为是二本大学，在全国基本是本科二批招生。
湖南工程学院
在湖南是本科一批招生，因此通常被认为是一本大学。
河南工程学院
通常被认为是二本大学，在全国基本是本科二批招生。
空军工程大学
被认为是一本大学，因为其在普通类最前的招生批次。
南京工程学院
在江苏是本科批次招生，但具体是一本还是二本可能因省份而异。
综上所述，沈阳工程学院和河南工程学院通常被认为是二本大学，而沈阳工业大学、武汉工程大学、湖南工程学院和空军工程大学通常被认为是一本大学。成都理工大学工程技术学院和南京工程学院则根据具体省份的招生政策，可能被视为一本或二本。
建议在选择学校时，除了考虑学校的批次外，还要综合考虑学校的教学质量、专业实力、就业情况等因素。