南京鼓楼区拥有多所著名大学，其中包括：
南京大学：
简称“南大”，是一所历史悠久、声誉卓著的百年名校，拥有鼓楼、仙林、浦口、苏州四个校区。
南京师范大学：
简称“南京师大”，是首批国家“211工程”重点建设高校、国家“双一流”世界一流学科建设高校。
河海大学：
位于鼓楼区，是江苏省重点建设的大学之一。
南京工业大学：
位于鼓楼区，是一所重点建设的工科大学。
南京邮电大学：
位于鼓楼区，是通信和信息科学领域的重要大学。
南京财经大学：
位于鼓楼区，是一所财经类高等教育机构。
中国药科大学：
位于鼓楼区，是中国药学和生命科学领域的重要高等教育机构。
南京艺术学院：
简称“南艺”，是中国独立建制创办最早并延续至现今的高等艺术学府。
南京第二师范学院：
位于鼓楼区，是江苏省较早设置的省属公办本科学校之一。
这些大学在各自的领域有着深厚的学术积淀和影响力，为南京乃至全国的教育事业做出了显著贡献