海南大学在大学排名中相对较低的原因主要包括：
多学科实力不强：
海南大学在教育部学科评估中，与一些排名稍低的院校相比，进入B类的学科数量较少，学科门类覆盖也不够全面。
生源质量不足：
海南大学在软科排名中，无论是综合排名还是学生生源指数，都落后于一些非211工程的院校，如三峡大学。
地理位置偏远：
海南位于国内边远地区，缺乏知名企业和市场发展的机会，这影响了学生的实践能力和实习机会，进而影响了学校的整体排名。
王牌专业局限：
海南大学的王牌专业主要集中在作物类和水产类，属于区域性大学，因此在综合性排名中通常位置较低。
气候因素：
海南气候炎热，夏天时间长，对于不适应炎热天气的学生来说，生活条件可能较为艰苦。
师资力量不足：
优秀的教师资源往往流向经济发达的城市，海南大学在这方面也存在劣势。
尽管海南大学在211大学中的排名相对靠后，但放在全国所有本科大学中，海南大学依然位于前200强的位置，显示出其具备一定的综合实力。